Vakıf Üniversitelerine Bağlı Hastanelerin Kurumlar Vergisi Muafiyeti ve KDV İstisnası Kaldırıldı

17 Nisan 2026 tarihli Resmi Gazete’de yayınlanarak yürürlüğe giren 7577 sayılı Bazı Kanunlarda Değişiklik Yapılmasına Dair Kanun ile vakıf üniversitelerine bağlı faaliyet gösteren hastane ve benzeri sağlık kuruluşlarının vergi statülerinde değişiklikler yapılmıştır.

Kanun değişikliği ile vakıf üniversitesi hastanelerinin ve benzeri sağlık kuruluşlarının kurumlar vergisi muafiyeti ve sundukları hizmetlerdeki KDV istisnası sonlandırılmıştır.

Kurumlar Vergisi Muafiyetinin Kaldırılması

2547 sayılı Yükseköğretim Kanunu’nun 56. maddesi ile ek 7. maddesi uyarınca vakıf üniversiteleri, genel bütçeye dahil kamu kurum ve kuruluşlarına tanınan mali kolaylık, muafiyet ve istisnalardan aynen yararlanmaktaydı. Bu çerçevede, 5520 sayılı Kurumlar Vergisi Kanunu’nun 4. maddesinin birinci fıkrasının (b) bendi kapsamında; “[k]amu idare ve kuruluşları tarafından genel insan ve hayvan sağlığını korumak ve tedavi amacıyla işletilen hastane, klinik, dispanser, sanatoryum, huzurevi, çocuk bakımevi, hayvan hastanesi ve dispanseri, hayvan bakımevi, veteriner bakteriyoloji, seroloji, distofajin kuruluşları ve benzeri kuruluşlar[a]” tanınan kurumlar vergisi muafiyeti, vakıflarca kurulan yükseköğretim kurumlarına bağlı hastane ve benzeri sağlık kuruluşları için de geçerliydi.

7577 sayılı Kanun’un 2. maddesi ile Yükseköğretim Kanunu’nun ek 7. maddesi değiştirilmiş; bu değişiklikle vakıflarca kurulan yükseköğretim kurumları bünyesinde faaliyet gösteren hastaneler ve benzeri sağlık kuruluşları, Kurumlar Vergisi Kanunu’nun 4. maddesinin birinci fıkrasının (b) bendi kapsamındaki muafiyet dışında bırakılarak kurumlar vergisi muafiyetinden çıkarılmıştır.

KDV İstisnasının Kaldırılması

3065 sayılı Katma Değer Vergisi Kanunu’nun 17. maddesinin ikinci fıkrasının (a) bendi uyarınca; Cumhurbaşkanınca vergi muafiyeti tanınan vakıflar tarafından yürütülen “hastane, nekahathane, klinik, dispanser, prevantoryum, sanatoryum, kan bankası ve organ nakline mahsus bankalar, anıtlar, botanik ve zooloji bahçeleri, parklar ile veteriner, bakteriyoloji, seroloji ve distofajin laboratuvarları gibi kuruluşlar[ı], … işletmek veya yönetmek suretiyle ifa ettikleri kuruluş amaçlarına uygun teslim ve hizmetleri ile bunlardan sağlık hizmeti sunanların teşhis ve tedaviye yönelik olarak birbirlerine yapacakları teslim ve hizmetler” katma değer vergisi istisnası kapsamında değerlendirilmekteydi.

7577 sayılı Kanun’un 3. maddesi ile Katma Değer Vergisi Kanunu’nun 17. maddesinin ikinci fıkrasının (a) bendinde değişiklik yapılmış; Cumhurbaşkanınca vergi muafiyeti tanınan vakıflarca kurulan yükseköğretim kurumlarına bağlı hastane ve benzeri sağlık kuruluşlarının sunduğu hizmetler KDV istisnası dışına çıkarılmıştır.

Anılan değişiklikler 1 Ocak 2027 tarihinde yürürlüğe girecektir.

7577 sayılı Kanun’a buradan ulaşabilirsiniz.